Yo! Az RNS -izotermikus amplifikációs készletek szállítója vagyok, és ma szeretnék beszélgetni arról, hogy ezeknek a készleteknek az egysejtes RNS -amplifikációhoz való felhasználása megvalósítható.
Először is, értsük meg, miről szól az egyetlen - sejt RNS -amplifikáció. Egyetlen - sejt RNS szekvenálás (SCRNA - SEQ) játékká vált - váltó a biológiai kutatásban. Ez lehetővé teszi számunkra, hogy megvizsgáljuk az egyes sejtek génexpressziós mintáit, ami szuper fontos, mivel a szövetekben a sejtek nem azonosak. Nagyon sok heterogenitás lehet, és a SCRNA - SEQ segít nekünk ezeknek a különbségeknek az egyetlen sejt szintjén. De itt van a fogás: Az RNS mennyisége egyetlen sejtben rendkívül kicsi. A pikogramszintekről beszélünk. És a legtöbb downstream elemzési technikához sokkal nagyobb mennyiségű RNS -re van szükségünk. Itt jön be az amplifikáció.
Szóval, mi lenne, ha az RNS -izotermikus amplifikációs készleteket használnánk erre a feladatra? Nos, belemerüljünk az előnyeibe és hátrányaiba.
Előnyök
1. Egyszerűség
Az izotermikus amplifikáció egyik legnagyobb előnye az egyszerűség. A hagyományos PCR -rel ellentétben, amelyhez a termikus ciklushoz különböző hőmérsékleti ciklusokon (denaturáció, lágyítás és meghosszabbítás) van szükség, az izotermikus amplifikáció állandó hőmérsékleten történik. Ez azt jelenti, hogy nincs szüksége divatos és drága termikus ciklusra. Az amplifikációs reakciót egyszerű hőblokkban vagy akár vízfürdőben hajthatja végre. Azoknak a kutatóknak, akik egy -egy sejt RNS -amplifikációt végeznek költségvetéssel vagy kevésbé felszerelt laboratóriumban, ez egy hatalmas plusz.
2. Sebesség
Az izotermikus amplifikáció általában elég gyors. Nagy mennyiségű amplifikált RNS -t generálhat viszonylag rövid idő alatt. Amikor egysejtes mintákkal foglalkozik, az idő lényege. Nem akarja, hogy órákig várjon, amíg az amplifikáció befejeződik. A miénkMira RNA izotermikus gyors amplifikációs készlet Basic - IIÚgy tervezték, hogy gyors eredményeket adjon, így tovább léphet a kísérlet következő lépésére anélkül, hogy túl sok időt pazarolna.
3. Érzékenység
Ezek a készletek nagyon érzékenyek. Tudják kimutatni és amplifikálni az egyes sejtekben az alacsony bőségű RNS -transzkripciókat is. Az egysejtes elemzésben gyakran vannak olyan ritka átiratok, amelyek kulcsfontosságúak a sejtek működésének és fejlődésének megértéséhez. Izotermikus amplifikációs készleteink felvehetik ezeket a ritka transzkriptumokat és erősíthetik azokat, lehetővé téve, hogy átfogóbb képet kapjon a gén expressziós profiljáról egyetlen sejtben.
4. Kompatibilitás
Az izotermikus amplifikáció kompatibilis a downstream alkalmazások széles skálájával. Függetlenül attól, hogy RNS -szekvenálást, QPCR -t vagy más elemzési módszereket szeretne elvégezni, a készleteinkből származó amplifikált RNS használható. Ez a rugalmasság nagyszerű, mert lehetővé teszi a kutatási kérdés legmegfelelőbb elemzési módszerének kiválasztását.
Hátrányok
1. elfogultság
Bármely amplifikációs módszer egyik fő hátránya az elfogultság. Az izotermikus amplifikáció sem kivétel. Különböző RNS -transzkripciók különböző sebességgel amplifikálódhatnak, ami az eredeti RNS populáció pontatlan ábrázolásához vezethet az egysejtben. Ez az elfogultság befolyásolhatja a downstream elemzés eredményeit, megnehezítve a génexpressziós szintek pontos számszerűsítését. K + F csapatunk azonban keményen dolgozik annak érdekében, hogy minimalizálja ezt az elfogultságotMira RNS izotermikus gyors amplifikációs készlet nukleinsav tesztcsík- Optimalizáltuk a reakcióviszonyokat és az enzimkészítményeket, hogy az amplifikációt a lehető legszélesebb körűvé tegyük.
2. A szennyeződés kockázata
Mivel az izotermikus amplifikáció nagy mennyiségű erősített terméket generálhat, nagyobb a szennyeződés kockázata. Még egy apró mennyiségű szennyező RNS vagy DNS is amplifikálható, és megjelenhet az eredményeiben. Ez hamis pozitív és pontatlan adatokhoz vezethet. Ennek a kockázatnak a csökkentése érdekében fontos a szigorú laboratóriumi protokollok, például a dedikált pipetták használata, a tiszta motorháztetőben való munka és a megfelelő fertőtlenítő módszerek használatának követése.
Megvalósíthatóság különböző kutatási forgatókönyvekben
1. Fejlesztési biológia
A fejlődési biológiában döntő fontosságú annak megértése, hogy a sejtek hogyan differenciálódnak és fejlődnek. Az egysejtes RNS -amplifikáció segíthet a kutatóknak az ezekben a folyamatokban részt vevő kulcsfontosságú gének és jelátviteli útvonalak azonosításában. RNS -izotermikus amplifikációs készleteink itt nagyon hasznosak lehetnek. Például egy embrió korai fejlesztésének tanulmányozásakor az egysejt -elemzés feltárhatja a génexpressziós változásokat, amelyek a sejtek specializálódásakor fordulnak elő. Készleteink egyszerűsége és sebessége lehetővé teszi a kutatók számára, hogy gyorsan amplifikálják az RNS -t ezekből az értékes single -sejtmintákból, és megkezdjék az adatok elemzését.
2. Rákkutatás
A rák egy komplex betegség, és az egysejtes RNS -elemzés betekintést nyújthat a tumorsejtek heterogenitásába. A tumoron belüli különböző sejtek eltérő génexpressziós profilokkal rendelkezhetnek, amelyek befolyásolhatják viselkedésüket, például metasztázisokat és a gyógyszerrezisztenciát. Készleteink felhasználhatók az egyes rákos sejtek RNS -jének amplifikálására, lehetővé téve a kutatók számára, hogy ezeket a különbségeket molekuláris szinten tanulmányozzák. Készleteink magas érzékenysége észlelheti a ritka átiratokat, amelyek összefüggésben lehetnek a rák progressziójával vagy a gyógyszer válaszával.
3. Immunológia
Az immunológiában az egysejtes RNS analízis segíthet megérteni a különböző immunsejt -alcsoportok működését. Például a T -sejtek eltérő altípusokkal rendelkezhetnek, mindegyik egyedi génexpressziós mintázatú. RNS -izotermikus amplifikációs készleteink felhasználhatók az egyes T -sejtek RNS -jének amplifikálására, lehetővé téve a kutatók számára, hogy tanulmányozzák a génexpressziós változásokat, amelyek immunválasz során bekövetkeznek.
Minőség -ellenőrzés
Az RNS izotermikus amplifikációs készleteink használatakor az egysejtes RNS amplifikációhoz elengedhetetlen a minőség -ellenőrzés. Mindig negatív vezérlést kell futtatnia, hogy ellenőrizze a szennyeződést. Ezenkívül jó ötlet a Spike használatát - az RNS -kontrollokban. Ezek ismert RNS -szekvenciák, amelyeket egy ismert koncentrációban ad hozzá az egyetlen sejtmintához. A tüske amplifikációs eredményeinek összehasonlításával - a kontrollokban a tényleges egyetlen - sejt RNS -vel, felmérheti az amplifikációs reakció hatékonyságát és torzítását.
Ezenkívül gélelektroforézist vagy kapilláris elektroforézist használhat az amplifikált RNS méreteloszlásának ellenőrzésére. A jó amplifikációs eredménynek meg kell mutatnia az RNS méretének viszonylag széles tartományát, ami azt jelzi, hogy számos átiratot amplifikáltak.
Következtetés
Összegezve, az RNS izotermikus amplifikációs készleteink felhasználása az egysejtes RNS amplifikációhoz határozottan megvalósítható. Noha vannak olyan kihívások, mint például az elfogultság és a szennyeződés kockázata, az egyszerűség, a sebesség, az érzékenység és a kompatibilitás előnyei sok kutatási forgatókönyv számára nagyszerű lehetőséget kínálnak számukra. Akár alapkutatási laboratóriumban, akár klinikai kutatási környezetben tartózkodik, a készleteink segíthetnek abban, hogy a lehető legtöbbet hozza ki az egyetlen sejt RNS -mintáiból.
Ha érdekli, hogy többet megtudjon az RNS izotermikus amplifikációs készleteinkről, vagy bármilyen kérdése van az egysejtes RNS -amplifikációhoz való felhasználással kapcsolatban, nyugodtan lépjen fel. Mindig örülünk, hogy beszélgetünk és segítünk a kutatási igényeiben. És ha készen áll a vásárlásra, itt vagyunk, hogy megkönnyítsük a beszerzési folyamat. Felfedezheti termékcsaládunkat, beleértve aMira DNS izotermikus gyors amplifikációs készlet alapvető, weboldalunkon, és kezdje el utazását egyetlen sejt RNS -elemzéssel.
Referenciák
- Tang, F., Barbacioru, C., Wang, Y., Nordman, E., Lee, C., Xu, N.,… és Surani, MA (2009). MRNS - SEQ teljes - Transkriptome elemzése egyetlen sejt. Nature Methods, 6 (5), 377 - 382.
- Van Dijk, DF, NANYS, J., Guo, G., Sharma, R., Khodosevich, K., Adonis, X., ... és Van Oudenaarden, A. (2018). Tíz év egysejtes rNNS -szekvenálás. Nature Communications, 9 (1), 1 -
- Chen, F. és Macosko, EZ (2019). Egyetlen sejt RNS szekvenálási technológiák és bioinformatikai csővezetékek. Nature Protocols, 14 (4), 1 202 - 1 226.